『サイファー』は、かとうひろしによって『月刊コロコロコミック』（小学館）に1995年10月号から1996年8月号まで連載された少年漫画。単行本（てんとう虫コミックス）は全2巻（現在絶版）。
この作品は、それまでタイアップ漫画が中心であったかとうひろしが『コロコロ』で再デビューを飾った後の初オリジナル作品である。
「激闘英雄伝・ワールドヒーローズ」が終了し、編集部から「オリジナルをやってみないか?」という案がサジェストされ、読みきり作品からはじまり「オリジナル作品の連載獲得」への日々が続くこととなる。
ラフ案、スケッチなどを含めその執筆量は200ページ以上に及んだともいわれる。
そして、1995年に編集会議をクリアし、ついに『コロコロコミック』で初となるかとうひろしオリジナル作品が連載されることとなる。それが、今作「サイファー」である。
この作品はのちのかとう作品にも通じる怪奇恐怖路線の連載第一作ともなり、現在において作品そのものは同業者をはじめ成長した連載当時の読者などからも高い評価を与えられ、公式サイトでも「サイファーIIを作って欲しい」「番外篇が読んでみたい」と言った要望が絶えない。
このような現在の再評価から2008年発売の『熱血!!コロコロ伝説』最終刊に同作が収録されることが決定していたものの、最終的に選考から漏れてしまい、作者をはじめ多くの読者が落胆した（但し、『熱血!!コロコロ伝説』のコンビニコミック版第2巻『恐愕!!トラウマまんが傑作選』に本作の第1話と第3話が収録された）。代わりにかとう作品では「仮面ライダーSD 疾風伝説」が1991-1992に収録されている。
また、作者が専門学校向けなどに執筆した「マンガのマンガ」という作品ではこの作品の導入部を利用し、どういった構成が読者を惹きつけるかという題材として紹介されている。
今では漫画のほうは絶版になっていますが、
携帯電話の漫画配信サービスで読むことができます。
かなりよく作られている作品だな、と思います。